问题标题:
PCR扩增引物3'端为什么不能有连续的3个C或3个G?在PCR扩增中,引物选择原则之一是“四种碱基应随机分布,在3'端不能存在连续3个C或3个G,易导致错误引发”.为什么存在连续的3个C或3个G就会导致
问题描述:

PCR扩增引物3'端为什么不能有连续的3个C或3个G?

在PCR扩增中,引物选择原则之一是“四种碱基应随机分布,在3'端不能存在连续3个C或3个G,易导致错误引发”.为什么存在连续的3个C或3个G就会导致错误引发呢?

崔光照回答:
  我随便说说,GC控制退火温度的能力比AT强很多,所以如果有三个G或者三个C,他们就有能在模板上对应的位置退火上去的可能,形成Taq酶的结合构象,从而扩增,因为5端不需要特异性结合照样能扩增.
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